En esta etapa, usted básicamente, tendrá que decirle al servidor la relación entre las columnas de su archivo y los datos que el sistema precisa para funcionar.

El sistema precisa de cuatro informaciones para operar: Nombre del individuo, Marcador, alelo 1 y alelo 2. En la pantalla aparecerá el nombre del primer dato de cada columna de su archivo.

Usted deberá indicarle al sistema, las columnas que serán utilizadas y lo que  representan, si representan individuos, marcadores, primer o segundo alelo. A partir de esos datos, el GenomiCalc sabrá como extraer los datos necesarios para hacer los cálculos.

Usted también deberá indicarle al sistema si su archivo presenta homocigotos y si posee encabezamiento. Para indicar esas opciones haga clic en los botones "Usar Homocigoto" y "Archivo con encabezamiento".

El sistema salva automáticamente la estructura indicada, por lo tanto, una vez hecho el levantamiento, no será necesario hacerlo de nuevo.

Siga los ejemplos abajo de levantamiento de archivos hechos con archivos extraídos de dos software diferentes que reciben archivos del secuenciador:

1) Usando archivos del Geno Typer de Applied Biosystems

Los archivos en txt (texto) presentan informaciones como por ejemplo:

En el levantamiento debemos indicar:
File Name - Nombre del Individuo
Category - Marcador
Peak 1 - Alelo 1
Peak 2 - Alelo 2
Peak 1 - No utilizar
Peak 2 - No utilizar

2) Usando archivos del GeneMapperID de Applied Biosystems

Sample Name - Nombre del Individuo
Marker - Marcador
Allele 1 - Alelo 1
Allele 2 - Alelo 2

En estos dos ejemplos los archivos presentan un encabezamiento, es importante señalar la opción "Archivo con encabezamiento" para que el sistema entienda que los nombres no hacen parte del cálculo.